怀孕三个月出现肚子右侧隐隐作痛，主要见于以下几种原因：

　　第一，先兆流产，先兆流产往往会出现下腹隐隐作痛，有些也会出现阴道流血，出现这种情况，建议尽早到医院完善相关检查，特别是B超检查，了解胚胎在宫内的发育情况，如果胚胎发育好，建议给予保胎治疗，如果胚胎发育不良或者出现停育的现象，建议尽早终止妊娠。

　　第二，右侧附件发炎或是盆腔发炎，这种情况下也会出现肚子作痛。

　　第三，阑尾炎，阑尾炎经常出现转移性右下腹痛，所以在孕期也要警惕阑尾炎发生。